مطالعه بیوانفورماتیکی خانوادة ژنی آنتی‌پورترهای کلسیم/کاتیون (CaCAs) در ذرت (Zea mays L.)
نویسندگان
چکیده مقاله:
پروتئین‌های خانواده آنتی‌پورتر یون کلسیم/کاتیون (CaCA) نقش حیاتی در هموستازی یون کلسیم دارند که یک رویداد مهم در طول نمو و پاسخ دفاعی گیاه است. در مطالعه حاضر با استفاده از داده‌های بانک‌های اطلاعاتی مرتبط، 14 ژن CaCAs در ژنوم ذرت شناسایی و براساس سازماندهی ساختاری و ارتباط تکاملی آن‌ها با پروتئین‌های شناسایی‌شده به سه گروه CAX، CCX و MHX طبقه‌بندی شدند. بیشتر پروتئین‌های ZmCaCA دارای دو دمین Na_Ca_ex بودند. تمامی ژن‌های شناسایی‌شده دارای حداقل یک موتیف کارکردی بوده و ساختار ژنی هر زیر گروه CaCA بسیار حفاظت شده است. در پیش‌بینی مولکول-های miRNA واکنش‌گر نسبت به ژن‌های CaCA در ذرت 33 نوع miRNA متفاوت شناسایی شد که در تنظیم بیان پس از رونویسی 13 ژن CaCAs از طریق برش mRNA یا ممانعت از ترجمه دخالت دارند. علاوه بر این، چندین عنصر تنظیمی cis پاسخ به تنش‌ها و هورمون‌ها در پیش‌بر این ژن‌ها شناسایی شد. بیان متغیر اکثر ژن‌های ZmCaCA در مراحل مختلف رشد و نمو، نقش مشخص آن‌ها در نمو ذرت را نشان می-دهد. همچنین القاء بیان این ژن‌ها در پاسخ به تنش‌های غیر زیستی (سرما، شوری، خشکی) کارکرد دفاعی ژن‌های ZmCaCA را مشخص نمود. بیشترین افزایش و کاهش بیان ژن مربوط به ژن‌های CAX است. نتایج این مطالعه اطلاعات پایه در مورد روابط فیلوژنی و کارکردهای احتمالی ژن‌های CaCA ذرت را برای پژوهش‌های آتی فراهم می‌سازد.
منابع مشابه
Maize (Zea mays L.).
Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation is an effective method for introducing genes into maize. In this chapter, we describe a detailed protocol for genetic transformation of the maize genotype Hi II. Our starting plant material is immature embryos cocultivated with an Agrobacterium strain carrying a standard binary vector. In addition to step-by-step laboratory transformation proced...
متن کاملB chromosomes in popcorn (Zea mays L.).
Cytological analysis of microsporogenesis in 72 popcorn plants, comprising nine from the original population (CMS-43, S(0)) and 63 from seven cycles of self-fertilization (S(1) to S(7)), one plant of S(0) generation (plant 2) was identified with B chromosomes. The number of B chromosomes varied from two to three in the same anther. The pattern of chromosome pairing and meiotic behavior of Bs we...
متن کاملواکنش رشد هیبرید‌های ذرت (Zea mays L.) به کود نیتروژن
به منظور بررسی اثر مقادیر کود نیتروژن بر ویژگی‌‌های مورفولوژیکی، عملکرد و اجزای عملکرد دانه هیبرید‌های ذرت در شرایط محیطی اندیمشک، این تحقیق در سال زراعی 91-1390 به‌صورت کرت خرد شده در قالب طرح بلوک‌‌های کامل تصادفی با سه تکرار انجام شد. چهار مقدار کود نیتروژن (بدون کود، 90، 180 و 260 کیلوگرم نیتروژن خالص در هکتار) از منبع کود اوره (46 درصد نیتروژن) در کرت‌های اصلی و چهار هیبرید ذرت (سینگل کراس...
متن کاملاثر تنش خشکی روی برخی صفات فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی دو رقم ذرت )zea mays l. 704 & zea mays l. 301)
چکیده ندارد.
15 صفحه اولمطالعه تغییرات میزان بیان دو ژن از خانواده ژنی ZmPIPتحت تنش های محیطی غیرزنده در برگ ذرت (Zea mays cv704)
مقدمه گیاهان پیوسته در معرض مجموعه‌ای از عوامل محیطی تنش‌زا قرار می‌گیرند که این عوامل تنش‌زا بسیاری از جنبه‌های ژنتیک و زیست مولکولی گیاه را تحت تاثیر خود قرار می‌دهند. در این بین شوری (NaCl ,CaCl2)، خشکی از مهمترین عوامل تنش‌زای محیطی به حساب می‌آیند. برای مقابله با این شرایط، گیاه باید قادر به درک، پاسخ‌دهی و سازگاری نسبت به این تغییرات محیطی باشد. مسیر signal transduction و ژن‌های مربوط به ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 9 شماره 29
صفحات 21- 37
تاریخ انتشار 2020-05-21
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023